Анализ по Нечипоренко проводится с целью выявления скрытой лейкоцитурии и эритроцитурии (не обнаруженные при общем анализе мочи), а также для динамического наблюдения за эффективностью проводимого лечения. Кроме того, данный анализ позволяет провести предварительный дифференциальный диагноз между инфекционными заболеваниями и патологией имеющею иную причину. Так, если имеет место преимущественное повышение количества лейкоцитов, необходимо думать об инфекционном поражении (цистит, пиелонефрит), если имеет место выраженное повышение количества эритроцитов необходимо исключить мочекаменную болезнь (камни почек, камень мочеточника, камни мочевого пузыря), гломерулонефрит, опухолевые процессы (опухоль почки, опухоль мочеточника, опухоль мочевого пузыря).